曾經(jīng)就職于北京大學(xué)人民醫(yī)院泌尿外科，擔(dān)任科副主任、主任醫(yī)師、教授。2004年底調(diào)入首都醫(yī)科大學(xué)，任首都醫(yī)科大學(xué)泌尿外科研究所副所長、北京朝陽醫(yī)院泌尿腎病診療中心主任兼泌尿外科主任，博士生導(dǎo)師;學(xué)術(shù)兼職包括中國腎移植科學(xué)登記系統(tǒng)管理委員會副秘書長、中華醫(yī)學(xué)會器官移植分會委員、北京醫(yī)學(xué)會器官移植分會常委、中華醫(yī)學(xué)會及朝陽區(qū)醫(yī)學(xué)會醫(yī)療事故鑒定委員會專家;擔(dān)任《ChineseMedicalJournal》、《中華泌尿外科雜志》、《中華外科雜志》、《中華全科醫(yī)師雜志》《中華干細(xì)胞與移植雜志》、《移植雜志》等多種雜志編委，《國際移植與血液凈化雜志》副總編?，F(xiàn)主要從事腎移植及普通泌尿外科臨床、科研及教學(xué)工作。作為泌尿外科及器官移植的學(xué)科帶頭人，他帶領(lǐng)一支團(tuán)結(jié)、勤奮、學(xué)術(shù)性很強(qiáng)的醫(yī)療團(tuán)隊。近些年來，他們完成腎移植1000例以上，總計完成3000余例，其中包括240例親屬活體腎移植。特別是，近2年他們針對我國等待移植患者中有相當(dāng)比例的患者為致敏者(體內(nèi)預(yù)存抗體>20%)，開展了術(shù)前脫敏治療，并已完成了50例的致敏患者腎移植整體治療的臨床研究，此研究得到國內(nèi)外同行的認(rèn)可。2011年在國家自然科學(xué)基金的資助下，張小東教授及其研究小組深入的研究了免疫耐受在器官移植患者中的作用。他們與國內(nèi)外同行共同編寫了《腎移植治療學(xué)》。他曾經(jīng)長期擔(dān)任國際神經(jīng)泌尿?qū)W會亞洲執(zhí)行委員，在國內(nèi)進(jìn)行了大量的排尿功能障礙、尿失禁的治療與研究，出版了《尿動力學(xué)》。張小東教授的臨床工作一直涉及腔鏡及微創(chuàng)技術(shù)，他累計完成了經(jīng)尿道前列腺、膀胱手術(shù)數(shù)千例，近年來，采用腹腔鏡手術(shù)完成了大量泌尿外科手術(shù)，其中包括，活體供腎切取術(shù)、腎癌根治術(shù)、前列腺癌根治術(shù)、腎上腺腫瘤切除術(shù)、輸尿管切開取石術(shù)等。張小東教授參與編寫了《黃家駟外科學(xué)》、《吳階平泌尿外科學(xué)》等本領(lǐng)域的巨著，已經(jīng)累計完成學(xué)術(shù)論文100余篇。